Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Nhlrc3Q8CCH2 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms