Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NischQ80TM9 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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