Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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