Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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