Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ttc39dQ0VF76 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ttc39dQ0VF76 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ttc39dQ0VF76 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Ttc39dQ0VF76 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Ttc39dQ0VF76 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Ttc39dQ0VF76 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Ttc39dQ0VF76 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ttc39dQ0VF76 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ttc39dQ0VF76 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ttc39dQ0VF76 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
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Ttc39dQ0VF76 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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Ttc39dQ0VF76 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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