Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Otx2P80206 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms