Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms