Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VhlP40338 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VhlP40338 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VhlP40338 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VhlP40338 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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