Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sptan1P16546 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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