Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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