Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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Clip3B9EHT4 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Clip3B9EHT4 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Clip3B9EHT4 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Clip3B9EHT4 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Clip3B9EHT4 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms