Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Spocd1B1ASB6 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Spocd1B1ASB6 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Spocd1B1ASB6 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Spocd1B1ASB6 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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