Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms