Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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