Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn7Q9Z261 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms