Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Setbp1Q9Z180 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms