Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVJ9

Efemp2, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp2Q9WVJ9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efemp2Q9WVJ9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp2Q9WVJ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms