Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Carm1Q9WVG6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carm1Q9WVG6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms