Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnip1Q9WUU8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms