Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PplQ9R269 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PplQ9R269 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PplQ9R269 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PplQ9R269 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PplQ9R269 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PplQ9R269 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PplQ9R269 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms