Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Htra1Q9R118 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms