Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lamc3Q9R0B6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lamc3Q9R0B6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms