Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Usp21Q9QZL6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp21Q9QZL6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Usp21Q9QZL6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp21Q9QZL6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp21Q9QZL6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Usp21Q9QZL6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Usp21Q9QZL6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Usp21Q9QZL6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Usp21Q9QZL6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp21Q9QZL6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Usp21Q9QZL6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp21Q9QZL6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Usp21Q9QZL6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Usp21Q9QZL6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Usp21Q9QZL6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp21Q9QZL6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Usp21Q9QZL6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp21Q9QZL6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp21Q9QZL6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Usp21Q9QZL6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms