Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2e3Q9QXZ7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms