Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Limd1Q9QXD8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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