Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3a1Q9QX15 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms