Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Txnrd1Q9JMH6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Txnrd1Q9JMH6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms