Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tnfrsf19Q9JLL3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tnfrsf19Q9JLL3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tnfrsf19Q9JLL3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tnfrsf19Q9JLL3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tnfrsf19Q9JLL3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms