Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LitafQ9JLJ0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LitafQ9JLJ0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LitafQ9JLJ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms