Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
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Tgm1Q9JLF6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Tgm1Q9JLF6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Tgm1Q9JLF6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Tgm1Q9JLF6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tgm1Q9JLF6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm1Q9JLF6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms