Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtsmQ9JL96 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms