Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Gde1Q9JL56 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Gde1Q9JL56 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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Gde1Q9JL56 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gde1Q9JL56 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms