Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hip1rQ9JKY5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hip1rQ9JKY5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms