Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms