Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb3Q9JKS4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms