Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard6bQ9JK83 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms