Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms