Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad9Q9JIW5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms