Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl28Q9JIL2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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