Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc22Q9JIG7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms