Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp29Q9ES63 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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