Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap29Q9ERB0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms