Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med27Q9DB40 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms