Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Y7

1700025F22Rik, RIKEN cDNA 1700025F22, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025F22RikQ9D9Y7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms