Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms