Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4bQ9D9F7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms