Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms