Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chmp4bQ9D8B3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms