Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slx4ipQ9D7Y9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms