Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capns2Q9D7J7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms